9月13日，根據省、市防指要求，市交通運輸部門嚴格落實臺風“燦都”防御工作，密切關注氣象預警信息并及時傳達，全力做好防臺防汛各項應對工作。

交通部門加強對橋梁、隧道及過街道設施巡查，13日當天共出動巡查車次20次，巡查橋隧設施219座，同時備足了沙袋，防水板等防汛物資，出現險情立即啟動預案，安排處置，保障設施運行安全。干線公路方面，安排相關人員在沿線排查交安設施、泄水孔和易積水點，清點防汛物資，確保降雨期間路面路基排水通暢。

公共交通方面，南京地鐵啟動防汛應急預案及惡劣天氣行車組織應急預案。加強地鐵沿線巡查力量，落實各項準備工作。南京有軌電車公司控制中心根據實際情況調整運營班次，利用監控查看站臺設施設備情況及正線軌道積水情況，安排專業人員夜間值守。南京市公交集團及東山公交公司啟動應急預案，督促各分公司及車隊開展防臺工作，站調人員及時通過GPS了解、掌握車輛在線路上運行狀況，適時通過發送指令提示駕駛員謹慎駕駛。目前，南京輪渡公司已啟動惡劣氣候應急預案，寧浦線、燕八線已于昨天6時停航。

截至9月13日13時，南京航道整體情況安全穩定，交通部門轄區內水上風景旅游區游覽船已經停航，水上水下活動停止作業，內河運輸船舶禁止進入長江，五馬渡游船碼頭停止經營、汽渡中心則重點對渡船動力、躉船系泊、棧橋抗風能力、相關物資儲備進行檢查，因江面風力較大，汽渡中心于昨天11時20分采取了停航措施。

在道路運輸方面，交通部門通知轄區內各道路運輸企業及時做好防范應對工作。全面開展隱患排查，做好廠房、工棚和臨時建筑物、室外宣傳牌、樹木等防臺風加固工作，防止出現墜落、倒塌、折斷、觸電等安全事故。同時，根據應急救援方案，組織車輛及部分企業應急救援隊伍，籌建防汛防臺風應急保障救援隊。目前，相關道路運輸企業已做好防臺風應急措施準備。

交通部門還要求在建工程項目結合工程實際和施工特點，嚴格落實大風、暴雨安全防護措施，臺風影響期間一律暫停戶外作業。市交通運輸系統將密切關注氣象信息，跟蹤預報預警，全力做好此次應對臺風的應急處置工作。